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脱落酸信号网络数据集,植物信号网络内各节点相互作用的布尔规则集

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Life Causal-Discovery

Data Set Information:其目的是确定描述该植物信号网络内各节点相互作用的布尔规则集。该数据集包括使用异步更新方案对真实规则......

数据结构 ? 14K

    Data Structure ?

    * 以上分析是由系统提取分析形成的结果,具体实际数据为准。

    README.md

    Data Set Information:

    其目的是确定描述该植物信号网络内各节点相互作用的布尔规则集。该数据集包括使用异步更新方案对真实规则进行的300次独立的布尔伪动力学模拟。这300次模拟中的每一次都从一个随机生成的初始条件开始,以确保对系统的所有稳定状态进行采样。这个数据集共有43个节点,其中5个节点是常数。

    数据集中包括了300次独立的模拟结果。每个模拟由一个0和1的矩阵组成,有21行和43列。第一行是随机生成的特定模拟的初始条件,接下来的20行是布尔伪动力学模拟的输出。43列中的每一列代表一个特定节点的瞬态响应。节点名称在数据文件的顶部标识。一行星号被用来把模拟与另一个模拟分开。下面是一组数据的例子。


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    Attribute Information:

    Each node can have a value of 0 or 1.  38 of the 43 nodes are allowed to vary, with 5 nodes held constant throughout the simulation.


    Relevant Papers:

    Li S, Assman SM, Albert R (2006) Predicting essential components of signal transduction networks: a dynamic model of guard cell abscisic acid signaling. Plos Biology 4: p. 1732-1748

    Soni, A.S., Jenkins, J.W., and Sundaram, S.S.: ”Determination of critical network interactions: An augmented Boolean pseudo-dynamics approach”, IET Systems Biology, vol. 2, p. 55-63 (2008).


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    Jerry W. Jenkins, Ph.D.
    Systems Biology and Bioinformations Group
    CFD Research Corporation
    215 Wynn Drive
    Huntsville, AL 35805
    email: jwj '@' cfdrc.com

    Abhishek Soni, Ph.D.
    Systems Biology and Bioinformations Group
    CFD Research Corporation
    215 Wynn Drive
    Huntsville, AL 35805
    email: axs '@' cfdrc.com




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